Así llegaron a la final Atlético Nacional y Chapecoense
Una final de Colombia vs Brasil, con un sorpresivo Chapecoense vs un cada vez más frecuente finalista Atlético Nacional. Ambos equipos enfrentaron grandes rivales y así fue su camino a la final de la Copa Sudamericana 2016.
| ATLÉTICO NACIONAL | CHAPECOENSE |
| Primera Fase | |
| Municipal 0-5 Atlético Nacional Atlético Nacional 1-0 Municipal | Libre |
| Segunda Fase | |
| Bolivar 1-1 Atlético Nacional Atlético Nacional 1-0 Bolivar | Cuiaba 1-0 Chapecoense Chapecoense 3-1 Cuiaba |
| Octavos de final | |
| Sol de América 1-1 Atlético Nacional Atlético Nacional 2-0 Sol de América | Independiente 0-0 Chapecoense Chapecoense (5) 0-0 (4) Independiente |
| Cuartos de final | |
| Coritiba 1-1 Atlético Nacional Atlético Nacional 3-1 Coritiba | Junior 1-0 Chapecoense Chapecoense 3-0 Junior |
| Semifinal | |
| Cerro Porteño 1-1 Atlético Nacional Atlético Nacional 0-0 Cerro Porteño | San Lorenzo 1-1 Chapecoense Chapecoense 0-0 San Lorenzo |
La final está calendarizada para:
- 30 de noviembre
- Atlético Nacional – Chapecoense
- 7 de diciembre
- Chapecoense – Atlético Nacional